Quando instalamos os programas que usamos diariamente, alguns deles por padrão já se auto inicializam com o sistema operacional. As vezes isso é necessário para alguns programas que você irá usar com frequência, por exemplo, o plugin "warsaw" do banco do Itaú.
Outros programas não necessariamente seja uma regra que inicialize pois o seu funcionamento não é tão essencial a sua tarefa diária. Isso se resolve, desabilitando sua inicialização através da opção "aplicativos de sessão", bastando escolher qual programa quer desabilitar.
Mas se o programa em questão é necessário somente as vezes ou até mesmo é um programa que no meu exemplo seja um "conky", "warsaw" ou até um atalho que você quer que inicie junto. Podemos então atrasar sua inicialização, assim ganhando um desempenho nessa questão.
Lembrando que você não irá atrasar a inicialização do sistema operacional e sim do programa selecionado.